GATE

Përshkrim

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) është një platformë e integruar kompjuterike kompjuterike për analizën dhe vizualizimin e serive kohore bio-molekulare me dimensione të larta. GATE përdor një algoritëm grupimi të bazuar në korrelacion për të rregulluar seritë kohore molekulare në një grup gjashtëkëndor dydimensional dhe ngjyron në mënyrë dinamike gjashtëkëndëshat individualë sipas nivelit të shprehjes së komponentit molekular të cilit i janë caktuar, për të krijuar filma të animuar të molekularëve të nivelit të sistemit. dinamika rregullatore. Në mënyrë që të nxirren mekanizmat e mundshëm të kontrollit rregullator nga modelet e korrelacionit, GATE gjithashtu lejon marrjen në pyetje interaktive të filmave kundrejt një shumëllojshmërie të gjerë të grupeve të të dhënave paraprake. Filmat GATE mund të ndërpriten dhe janë ndërveprues, duke i lejuar përdoruesit të rindërtojnë rrjetet dhe të kryejnë analiza të pasurimit funksional. Filmat e krijuar me GATE mund të ruhen në formatin Flash dhe të futen direkt në skedarët e dorëshkrimeve PDF si figura ndërvepruese.