MultiGeneBlast

Përshkrim

MultiGeneBlast është një mjet me burim të hapur i bazuar në një riformatim të titujve FASTA të hyrjeve të proteinave NCBI GenBank, duke përdorur të cilat mund të gjurmojë nukleotidin dhe koordinatat e tyre burimore. MultiGeneBlast mund të ndihmojë në zbulimin e pjesëve të tilla multigjenike për projektet e biologjisë sintetike. Një bibliotekë sintetike e operoneve mund të krijohet bazuar në daljen e saj për të identifikuar ata operone, funksioni i të cilëve është më i afërt me atë të dëshiruar nga përdoruesi. Ky mjet ofron mundësi për të identifikuar të gjitha rajonet gjenomike homologe duke kombinuar rezultatet e ekzekutimeve të vetme BlastP në secilin gjen dhe duke renditur rajonet gjenomike nga çdo hyrje e GenBank sipas numrit të goditjeve, ruajtjes së sintenisë dhe rezultatit kumulativ të bitit Blast. Kërkimet e arkitekturës mund të kryhen për të gjetur çdo rajon gjenomik me goditje Blast në çdo kombinim të sekuencave të aminoacideve të specifikuara nga përdoruesi.