GenoSuite

Përshkrim

GenoSuite është një kornizë e zhvilluar për analizën proteogjenomike. Strategjia e bazuar në FDRScore përdoret për të integruar rezultatet nga algoritme të shumta kërkimi. Mjeti Prokariotik Proteogjenomik (PPT) është zhvilluar si pjesë e kornizës GenoSuite. PPT është për gjetjen e përkthimeve të reja në gjenomet prokariote dhe varet nga të dhënat proteomike të bazuara në spektrometrinë e masës dhe sekuencën e lidhur të gjenomit. Veçoritë përfshijnë konfigurimin për 4 algoritme me burim të hapur për të kryer kërkimin e bazës së të dhënave për identifikimin e peptideve dhe mund të zgjidhet çdo kombinim i 4 algoritmit, liston peptidet specifike të kërkimit të gjenomit (peptide të reja), përputhjet spektrale mund të vizualizohen për vlerësimin e cilësisë, liston proteinat e reja dhe ndryshimet në shënimet ekzistuese të proteinave, si dhe një kontekst gjenomik vizual i peptideve të reja mund të gjenerohen gjithashtu.